Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PICALMQ13492 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PICALMQ13492 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PICALMQ13492 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PICALMQ13492 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PICALMQ13492 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PICALMQ13492 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PICALMQ13492 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PICALMQ13492 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PICALMQ13492 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PICALMQ13492 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
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