Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN4PQ13434 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MKRN4PQ13434 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKRN4PQ13434 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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