Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AP3B2Q13367 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
AP3B2Q13367 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AP3B2Q13367 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP3B2Q13367 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
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