Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLF1Q13351 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KLF1Q13351 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLF1Q13351 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLF1Q13351 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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