Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRSQ13332 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRSQ13332 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms