Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRSQ13332 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRSQ13332 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRSQ13332 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRSQ13332 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRSQ13332 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms