Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLAMF1Q13291 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLAMF1Q13291 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLAMF1Q13291 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms