Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGDRQ13258 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGDRQ13258 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTGDRQ13258 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGDRQ13258 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGDRQ13258 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
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