Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERCC8Q13216 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERCC8Q13216 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms