Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1BQ13112 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1BQ13112 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1BQ13112 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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