Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN2Q12907 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN2Q12907 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMAN2Q12907 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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