Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SFSWAPQ12872 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFSWAPQ12872 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFSWAPQ12872 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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