Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPQ12770 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPQ12770 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAPQ12770 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPQ12770 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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