Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 PRS4YBL068W 981 nt7.72□□□□□ -1.17
CTF3Q12748 MCP1YOR228C 909 nt7.72□□□□□ -1.17
CTF3Q12748 AVL9YLR114C 2295 nt7.72□□□□□ -1.17
CTF3Q12748 YML122CYML122C 381 nt7.71□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 PEX28YHR150W 1740 nt7.71□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 BDS1YOL164W 1941 nt7.7□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 OPI1YHL020C 1215 nt7.7□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 ZIM17YNL310C 525 nt7.7□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 PMT1YDL095W 2454 nt7.69□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 YDR215CYDR215C 414 nt7.69□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 snR4snR4 186 nt7.69□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.68□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 PET10YKR046C 852 nt7.68□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 CKB1YGL019W 837 nt7.67□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 DIA4YHR011W 1341 nt7.67□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 VPS65YLR322W 315 nt7.66□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 PUS4YNL292W 1212 nt7.66□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 LGE1YPL055C 999 nt7.66□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 YER152CYER152C 1332 nt7.66□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 PAB1YER165W 1734 nt7.66□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 PAM17YKR065C 594 nt7.65□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 SPE3YPR069C 882 nt7.65□□□□□ -1.18
CTF3Q12748 NFS1YCL017C 1494 nt7.64□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 PDA1YER178W 1263 nt7.64□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 CCW12YLR110C 402 nt7.64□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 DML1YMR211W 1428 nt7.63□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 YJL213WYJL213W 996 nt7.63□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 CAR2YLR438W 1275 nt7.63□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 NSG2YNL156C 900 nt7.63□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 snR30snR30 606 nt7.63□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 DCR2YLR361C 1737 nt7.62□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 AAD14YNL331C 1131 nt7.62□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 RCF2YNR018W 675 nt7.62□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 YOR111WYOR111W 699 nt7.62□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 MET13YGL125W 1803 nt7.62□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 FIT1YDR534C 1587 nt7.61□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 LEO1YOR123C 1395 nt7.6□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 NAF1YNL124W 1479 nt7.6□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 YPQ2YDR352W 954 nt7.59□□□□□ -1.19
CTF3Q12748 YLR162WYLR162W 357 nt7.58□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 SML1YML058W 315 nt7.58□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 PLB3YOL011W 2061 nt7.58□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 PDC5YLR134W 1692 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 MPH3YJR160C 1809 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 CBK1YNL161W 2271 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 UFD1YGR048W 1086 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 YPR130CYPR130C 408 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 DPM1YPR183W 804 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 CIT2YCR005C 1383 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 MLS1YNL117W 1665 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 YLR173WYLR173W 1827 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 TUB1YML085C 1344 nt7.55□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 BIO3YNR058W 1443 nt7.55□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 SNA3YJL151C 402 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 SNF7YLR025W 723 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 YAH1YPL252C 519 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 RSC9YML127W 1746 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 SNU66YOR308C 1764 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 MGM101YJR144W 810 nt7.53□□□□□ -1.2
CTF3Q12748 LDB7YBL006C 543 nt7.52□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 RTC4YNL254C 1206 nt7.52□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 GET4YOR164C 939 nt7.52□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 YCL049CYCL049C 939 nt7.52□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 DUS3YLR401C 2007 nt7.52□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 ERG10YPL028W 1197 nt7.51□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 MPE1YKL059C 1326 nt7.51□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 RUP1YOR138C 2016 nt7.51□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 PET117YER058W 324 nt7.5□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 ERG24YNL280C 1317 nt7.5□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 ADE16YLR028C 1776 nt7.49□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 CIA1YDR267C 993 nt7.49□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 SRY1YKL218C 981 nt7.49□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 AFG3YER017C 2286 nt7.49□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 HNM1YGL077C 1692 nt7.48□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 ERR3YMR323W 1314 nt7.48□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 YBL113CYBL113C 2379 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 PLB2YMR006C 2121 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 YOL046CYOL046C 675 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 MDH2YOL126C 1134 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 RTC2YBR147W 891 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 SGF73YGL066W 1974 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 TOP3YLR234W 1971 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 YHR131CYHR131C 2553 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 CYS4YGR155W 1524 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 PMT7YDR307W 1989 nt7.46□□□□□ -1.21
CTF3Q12748 TPI1YDR050C 747 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 ADE2YOR128C 1716 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 LPD1YFL018C 1500 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 YDR327WYDR327W 327 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 RDR1YOR380W 1641 nt7.44□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 YJL163CYJL163C 1668 nt7.44□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.43□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 DMC1YER179W 1005 nt7.43□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 TCB1YOR086C 3561 nt7.42□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.42□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 YPR076WYPR076W 375 nt7.42□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 YJL045WYJL045W 1905 nt7.42□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 YMR074CYMR074C 438 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF3Q12748 HTZ1YOL012C 405 nt7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 83.2 ms