Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 CST26YBR042C 1194 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 PUS7YOR243C 2031 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 PDA1YER178W 1263 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 NAS6YGR232W 687 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 YPL041CYPL041C 624 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 TOK1YJL093C 2076 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 HSV2YGR223C 1347 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 DIA4YHR011W 1341 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 PRS4YBL068W 981 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 ZIM17YNL310C 525 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 ALR1YOL130W 2580 nt7.46□□□□□ -1.21
LCB4Q12246 PIL1YGR086C 1020 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 MET30YIL046W 1923 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YDR215CYDR215C 414 nt7.45□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.45□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 CKB1YGL019W 837 nt7.45□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YML122CYML122C 381 nt7.45□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 MCP1YOR228C 909 nt7.45□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 BDS1YOL164W 1941 nt7.44□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YIL177CYIL177C 5277 nt7.44□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 PMT1YDL095W 2454 nt7.44□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 OPI1YHL020C 1215 nt7.44□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YJL144WYJL144W 315 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 PET10YKR046C 852 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YNL190WYNL190W 615 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 RCF2YNR018W 675 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 MDH2YOL126C 1134 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 ARO7YPR060C 771 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 PEX28YHR150W 1740 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 LEO1YOR123C 1395 nt7.43□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.42□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.42□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.42□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 SPE3YPR069C 882 nt7.42□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 LAS17YOR181W 1902 nt7.42□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 PMT7YDR307W 1989 nt7.41□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 COG1YGL223C 1254 nt7.41□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 CCW12YLR110C 402 nt7.41□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 snR30snR30 606 nt7.41□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 NFS1YCL017C 1494 nt7.41□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 SNA3YJL151C 402 nt7.4□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 AIM34YMR003W 597 nt7.4□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 YER152CYER152C 1332 nt7.4□□□□□ -1.22
LCB4Q12246 MET13YGL125W 1803 nt7.4□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 TOM71YHR117W 1920 nt7.39□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 CAR2YLR438W 1275 nt7.39□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 PUS4YNL292W 1212 nt7.39□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 LGE1YPL055C 999 nt7.39□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 PAM17YKR065C 594 nt7.38□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 DPM1YPR183W 804 nt7.38□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 YPR130CYPR130C 408 nt7.37□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 DCR2YLR361C 1737 nt7.37□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 DML1YMR211W 1428 nt7.36□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 PDC5YLR134W 1692 nt7.36□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 YLR162WYLR162W 357 nt7.34□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 NAF1YNL124W 1479 nt7.34□□□□□ -1.23
LCB4Q12246 PRC1YMR297W 1599 nt7.33□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 ITR1YDR497C 1755 nt7.33□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YJL213WYJL213W 996 nt7.33□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YOR111WYOR111W 699 nt7.33□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YAH1YPL252C 519 nt7.33□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 BIO3YNR058W 1443 nt7.32□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 PLB3YOL011W 2061 nt7.32□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 MPH3YJR160C 1809 nt7.31□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 RSC9YML127W 1746 nt7.3□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 CHA1YCL064C 1083 nt7.3□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 URH1YDR400W 1023 nt7.3□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 LDB7YBL006C 543 nt7.3□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 SML1YML058W 315 nt7.3□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 HNM1YGL077C 1692 nt7.3□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.29□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.29□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.29□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 FRA1YLL029W 2250 nt7.29□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YCL049CYCL049C 939 nt7.29□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 CIT2YCR005C 1383 nt7.29□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YBL113CYBL113C 2379 nt7.28□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 CIA1YDR267C 993 nt7.28□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 AAD14YNL331C 1131 nt7.28□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YTH1YPR107C 627 nt7.28□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 TUB1YML085C 1344 nt7.27□□□□□ -1.24
LCB4Q12246 YPQ2YDR352W 954 nt7.27□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 GET4YOR164C 939 nt7.27□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 TOP3YLR234W 1971 nt7.26□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 PET117YER058W 324 nt7.26□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 FAF1YIL019W 1041 nt7.26□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 RUP1YOR138C 2016 nt7.26□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 AFG3YER017C 2286 nt7.26□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 TPI1YDR050C 747 nt7.25□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 LCP5YER127W 1074 nt7.25□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 SGF73YGL066W 1974 nt7.25□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 BEM1YBR200W 1656 nt7.25□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 MPE1YKL059C 1326 nt7.25□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 RDR1YOR380W 1641 nt7.24□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 DMC1YER179W 1005 nt7.24□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 SRY1YKL218C 981 nt7.24□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 SNF7YLR025W 723 nt7.24□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 RTC4YNL254C 1206 nt7.24□□□□□ -1.25
LCB4Q12246 YPL264CYPL264C 1062 nt7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.8 ms