Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCNQ0VAF6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCNQ0VAF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCNQ0VAF6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms