Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SRSF4Q08170 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF4Q08170 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF4Q08170 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms