Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDSRQ06136 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDSRQ06136 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDSRQ06136 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDSRQ06136 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms