Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP7AQ04656 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ATP7AQ04656 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
ATP7AQ04656 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ATP7AQ04656 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
ATP7AQ04656 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms