Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARDQ03181 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PPARDQ03181 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARDQ03181 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms