Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 CIT3YPR001W 1461 nt6.64□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 PEX28YHR150W 1740 nt6.64□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 CKI1YLR133W 1749 nt6.64□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 YIL168WYIL168W 384 nt6.63□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 YMR253CYMR253C 1245 nt6.63□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 TIM50YPL063W 1431 nt6.63□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 RSC9YML127W 1746 nt6.62□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 MFG1YDL233W 1377 nt6.62□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 GGC1YDL198C 903 nt6.62□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 PUS5YLR165C 765 nt6.62□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 PRE10YOR362C 867 nt6.62□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 JHD1YER051W 1479 nt6.61□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 SNA3YJL151C 402 nt6.61□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 CIR2YOR356W 1896 nt6.6□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 YEN1YER041W 2280 nt6.6□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 YLR030WYLR030W 792 nt6.6□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 RBS1YDL189W 1374 nt6.59□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.59□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 DPH5YLR172C 903 nt6.59□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 MRP7YNL005C 1116 nt6.59□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 SEC24YIL109C 2781 nt6.59□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 AQR1YNL065W 1761 nt6.59□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 PET494YNR045W 1470 nt6.59□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 HXT8YJL214W 1710 nt6.59□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 RCF1YML030W 480 nt6.58□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 ATO2YNR002C 849 nt6.58□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 PSP2YML017W 1782 nt6.58□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 AVL9YLR114C 2295 nt6.58□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 SHO1YER118C 1104 nt6.57□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 WSC3YOL105C 1671 nt6.57□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 YCR061WYCR061W 1896 nt6.57□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 YBL113CYBL113C 2379 nt6.56□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 CKB1YGL019W 837 nt6.56□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 FHN1YGR131W 525 nt6.56□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 CTF3YLR381W 2202 nt6.56□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 YDR476CYDR476C 675 nt6.55□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 SNU71YGR013W 1863 nt6.55□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 POB3YML069W 1659 nt6.54□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 ASN2YGR124W 1719 nt6.53□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 YIL108WYIL108W 2091 nt6.53□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 HAC1YFL031W 717 nt6.53□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 CPT1YNL130C 1182 nt6.53□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 YBR226CYBR226C 411 nt6.53□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 MTC6YHR151C 1581 nt6.52□□□□□ -1.36
SKO1Q02100 EHD3YDR036C 1503 nt6.52□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 YOS9YDR057W 1629 nt6.52□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 CDA1YLR307W 906 nt6.52□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 ADH6YMR318C 1083 nt6.52□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 YNL165WYNL165W 1221 nt6.52□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 PRB1YEL060C 1908 nt6.52□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 SPR1YOR190W 1338 nt6.51□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 GFA1YKL104C 2154 nt6.51□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 PRE5YMR314W 705 nt6.51□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 ARG7YMR062C 1326 nt6.5□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 YGR137WYGR137W 375 nt6.5□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 YNL017CYNL017C 339 nt6.5□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 MSB3YNL293W 1902 nt6.5□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 MAL31YBR298C 1845 nt6.5□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 PNS1YOR161C 1620 nt6.5□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 MAS2YHR024C 1449 nt6.5□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 NMD5YJR132W 3147 nt6.5□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 CDC16YKL022C 2523 nt6.49□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 TCB1YOR086C 3561 nt6.49□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 GNA1YFL017C 480 nt6.49□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 APT1YML022W 564 nt6.49□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 CDC13YDL220C 2775 nt6.49□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 HOG1YLR113W 1308 nt6.49□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 RMD8YFR048W 1989 nt6.48□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 YER137CYER137C 447 nt6.48□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 RRP46YGR095C 672 nt6.48□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 TES1YJR019C 1050 nt6.48□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 TOD6YBL054W 1578 nt6.48□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 BNA3YJL060W 1335 nt6.48□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 VPS65YLR322W 315 nt6.47□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 FLC2YAL053W 2352 nt6.47□□□□□ -1.37
SKO1Q02100 YIP4YGL198W 708 nt6.46□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 SNP1YIL061C 903 nt6.46□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 YOR041CYOR041C 432 nt6.46□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 ADE17YMR120C 1779 nt6.46□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 NUP84YDL116W 2181 nt6.45□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 YBL111CYBL111C 2004 nt6.45□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 YLR358CYLR358C 564 nt6.45□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 RCF2YNR018W 675 nt6.45□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 CDC23YHR166C 1881 nt6.45□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 SDH8YBR269C 417 nt6.44□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 ENB1YOL158C 1821 nt6.43□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 HXT13YEL069C 1695 nt6.43□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 HNM1YGL077C 1692 nt6.43□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 PRP2YNR011C 2631 nt6.43□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 CPR2YHR057C 618 nt6.43□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 GDA1YEL042W 1557 nt6.43□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 BUD9YGR041W 1644 nt6.43□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 POX1YGL205W 2247 nt6.42□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 YPL247CYPL247C 1572 nt6.42□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 LEO1YOR123C 1395 nt6.42□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 RPR1RPR1 369 nt6.41□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 DCR2YLR361C 1737 nt6.41□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 DST1YGL043W 930 nt6.4□□□□□ -1.38
SKO1Q02100 GPA1YHR005C 1419 nt6.4□□□□□ -1.39
SKO1Q02100 NCA3YJL116C 1014 nt6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.1 ms