Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
OTUD4Q01804 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUD4Q01804 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD4Q01804 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD4Q01804 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms