Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRCDQ00LT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRCDQ00LT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRCDQ00LT1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.9 ms