Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL1Q00532 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL1Q00532 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms