Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNB1P98172 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB1P98172 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms