Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX5P78411 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX5P78411 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX5P78411 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX5P78411 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX5P78411 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX5P78411 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX5P78411 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX5P78411 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX5P78411 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX5P78411 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX5P78411 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX5P78411 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX5P78411 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX5P78411 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX5P78411 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX5P78411 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX5P78411 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX5P78411 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX5P78411 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX5P78411 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX5P78411 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX5P78411 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX5P78411 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX5P78411 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX5P78411 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX5P78411 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX5P78411 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX5P78411 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX5P78411 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX5P78411 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRX5P78411 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX5P78411 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX5P78411 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX5P78411 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX5P78411 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX5P78411 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX5P78411 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms