Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P68104 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1A1P68104 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEF1A1P68104 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms