Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL38P63173 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL38P63173 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL38P63173 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL38P63173 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL38P63173 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL38P63173 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL38P63173 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL38P63173 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL38P63173 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL38P63173 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL38P63173 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL38P63173 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL38P63173 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL38P63173 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL38P63173 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL38P63173 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL38P63173 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL38P63173 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL38P63173 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL38P63173 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL38P63173 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL38P63173 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL38P63173 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL38P63173 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL38P63173 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL38P63173 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL38P63173 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL38P63173 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL38P63173 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL38P63173 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL38P63173 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL38P63173 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL38P63173 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL38P63173 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL38P63173 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL38P63173 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL38P63173 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL38P63173 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL38P63173 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL38P63173 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL38P63173 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL38P63173 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL38P63173 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL38P63173 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL38P63173 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL38P63173 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL38P63173 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL38P63173 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL38P63173 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL38P63173 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL38P63173 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL38P63173 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL38P63173 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL38P63173 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL38P63173 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL38P63173 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL38P63173 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL38P63173 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL38P63173 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL38P63173 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL38P63173 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL38P63173 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL38P63173 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL38P63173 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL38P63173 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL38P63173 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL38P63173 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL38P63173 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL38P63173 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL38P63173 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL38P63173 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL38P63173 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL38P63173 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL38P63173 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL38P63173 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL38P63173 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL38P63173 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL38P63173 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL38P63173 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL38P63173 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL38P63173 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL38P63173 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL38P63173 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL38P63173 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL38P63173 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL38P63173 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL38P63173 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL38P63173 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL38P63173 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL38P63173 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL38P63173 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL38P63173 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL38P63173 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL38P63173 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPL38P63173 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPL38P63173 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL38P63173 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL38P63173 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL38P63173 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225 ms