Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4XP62701 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4XP62701 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4XP62701 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms