Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK11-1P61568 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK11-1P61568 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK11-1P61568 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK11-1P61568 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK11-1P61568 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK11-1P61568 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK11-1P61568 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK11-1P61568 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK11-1P61568 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK11-1P61568 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms