Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVS71-1P61550 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVS71-1P61550 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms