Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX16P57768 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX16P57768 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX16P57768 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX16P57768 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX16P57768 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX16P57768 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX16P57768 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX16P57768 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX16P57768 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX16P57768 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX16P57768 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX16P57768 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX16P57768 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX16P57768 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX16P57768 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX16P57768 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX16P57768 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX16P57768 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX16P57768 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX16P57768 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX16P57768 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX16P57768 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX16P57768 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX16P57768 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX16P57768 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX16P57768 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX16P57768 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX16P57768 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX16P57768 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX16P57768 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX16P57768 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX16P57768 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX16P57768 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX16P57768 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX16P57768 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX16P57768 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX16P57768 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX16P57768 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX16P57768 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX16P57768 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX16P57768 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX16P57768 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX16P57768 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX16P57768 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX16P57768 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX16P57768 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX16P57768 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX16P57768 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX16P57768 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX16P57768 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX16P57768 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX16P57768 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX16P57768 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX16P57768 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX16P57768 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX16P57768 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX16P57768 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX16P57768 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX16P57768 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX16P57768 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX16P57768 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX16P57768 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX16P57768 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX16P57768 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX16P57768 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX16P57768 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX16P57768 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX16P57768 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX16P57768 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX16P57768 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX16P57768 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX16P57768 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX16P57768 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX16P57768 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX16P57768 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX16P57768 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX16P57768 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX16P57768 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX16P57768 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX16P57768 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX16P57768 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX16P57768 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX16P57768 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX16P57768 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX16P57768 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX16P57768 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX16P57768 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX16P57768 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX16P57768 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX16P57768 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX16P57768 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX16P57768 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX16P57768 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX16P57768 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX16P57768 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX16P57768 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX16P57768 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX16P57768 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX16P57768 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms