Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDN2P57739 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN2P57739 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms