Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN17P56750 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN17P56750 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN17P56750 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN17P56750 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms