Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4CP56559 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARL4CP56559 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARL4CP56559 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms