Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFV3P56181 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFV3P56181 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms