Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTEP56180 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTEP56180 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTEP56180 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTEP56180 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTEP56180 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTEP56180 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTEP56180 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPTEP56180 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPTEP56180 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPTEP56180 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPTEP56180 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPTEP56180 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPTEP56180 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPTEP56180 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPTEP56180 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPTEP56180 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPTEP56180 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTEP56180 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTEP56180 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTEP56180 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTEP56180 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTEP56180 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTEP56180 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTEP56180 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTEP56180 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTEP56180 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTEP56180 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTEP56180 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTEP56180 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTEP56180 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTEP56180 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTEP56180 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTEP56180 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTEP56180 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTEP56180 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPTEP56180 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPTEP56180 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPTEP56180 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTEP56180 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTEP56180 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTEP56180 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTEP56180 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTEP56180 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTEP56180 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTEP56180 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTEP56180 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPTEP56180 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPTEP56180 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPTEP56180 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPTEP56180 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPTEP56180 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPTEP56180 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPTEP56180 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPTEP56180 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPTEP56180 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPTEP56180 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPTEP56180 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPTEP56180 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPTEP56180 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPTEP56180 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPTEP56180 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPTEP56180 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPTEP56180 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPTEP56180 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPTEP56180 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPTEP56180 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TPTEP56180 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPTEP56180 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPTEP56180 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPTEP56180 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPTEP56180 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPTEP56180 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPTEP56180 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPTEP56180 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPTEP56180 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPTEP56180 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPTEP56180 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPTEP56180 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPTEP56180 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPTEP56180 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPTEP56180 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms