Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUMO3P55854 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMO3P55854 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMO3P55854 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMO3P55854 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms