Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NAP1L1P55209 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NAP1L1P55209 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NAP1L1P55209 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms