Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MANFP55145 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MANFP55145 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MANFP55145 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MANFP55145 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MANFP55145 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MANFP55145 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MANFP55145 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MANFP55145 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MANFP55145 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MANFP55145 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MANFP55145 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MANFP55145 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MANFP55145 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MANFP55145 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MANFP55145 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MANFP55145 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MANFP55145 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MANFP55145 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MANFP55145 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MANFP55145 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MANFP55145 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MANFP55145 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MANFP55145 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MANFP55145 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MANFP55145 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MANFP55145 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MANFP55145 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MANFP55145 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MANFP55145 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MANFP55145 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MANFP55145 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MANFP55145 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MANFP55145 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MANFP55145 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MANFP55145 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MANFP55145 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MANFP55145 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MANFP55145 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MANFP55145 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MANFP55145 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MANFP55145 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MANFP55145 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MANFP55145 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MANFP55145 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MANFP55145 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MANFP55145 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MANFP55145 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MANFP55145 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MANFP55145 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MANFP55145 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MANFP55145 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MANFP55145 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MANFP55145 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MANFP55145 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MANFP55145 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MANFP55145 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MANFP55145 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MANFP55145 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MANFP55145 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MANFP55145 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MANFP55145 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MANFP55145 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MANFP55145 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MANFP55145 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MANFP55145 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MANFP55145 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MANFP55145 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MANFP55145 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MANFP55145 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MANFP55145 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MANFP55145 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MANFP55145 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MANFP55145 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MANFP55145 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MANFP55145 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MANFP55145 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MANFP55145 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MANFP55145 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MANFP55145 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MANFP55145 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MANFP55145 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MANFP55145 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MANFP55145 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MANFP55145 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MANFP55145 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MANFP55145 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MANFP55145 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MANFP55145 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MANFP55145 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MANFP55145 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms