Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPAP53621 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPAP53621 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPAP53621 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPAP53621 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPAP53621 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPAP53621 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COPAP53621 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPAP53621 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPAP53621 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPAP53621 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPAP53621 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COPAP53621 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPAP53621 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPAP53621 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPAP53621 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPAP53621 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPAP53621 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPAP53621 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPAP53621 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPAP53621 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPAP53621 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPAP53621 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPAP53621 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPAP53621 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPAP53621 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPAP53621 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPAP53621 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPAP53621 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPAP53621 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPAP53621 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPAP53621 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPAP53621 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPAP53621 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPAP53621 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COPAP53621 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COPAP53621 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPAP53621 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPAP53621 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPAP53621 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPAP53621 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPAP53621 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPAP53621 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPAP53621 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPAP53621 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPAP53621 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPAP53621 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPAP53621 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPAP53621 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPAP53621 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPAP53621 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPAP53621 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPAP53621 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPAP53621 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPAP53621 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPAP53621 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPAP53621 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPAP53621 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPAP53621 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPAP53621 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPAP53621 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPAP53621 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPAP53621 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPAP53621 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPAP53621 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPAP53621 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPAP53621 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COPAP53621 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPAP53621 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPAP53621 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COPAP53621 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPAP53621 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPAP53621 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPAP53621 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPAP53621 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COPAP53621 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPAP53621 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPAP53621 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPAP53621 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPAP53621 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPAP53621 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPAP53621 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPAP53621 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPAP53621 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPAP53621 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPAP53621 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPAP53621 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPAP53621 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPAP53621 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPAP53621 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COPAP53621 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms