Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA4P52798 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA4P52798 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA4P52798 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA4P52798 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EFNA4P52798 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA4P52798 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms