Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF140P52738 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF140P52738 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF140P52738 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF140P52738 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF140P52738 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF140P52738 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF140P52738 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF140P52738 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms