Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDR1P51861 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDR1P51861 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDR1P51861 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDR1P51861 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDR1P51861 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDR1P51861 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDR1P51861 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDR1P51861 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDR1P51861 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDR1P51861 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDR1P51861 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDR1P51861 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR1P51861 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR1P51861 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR1P51861 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR1P51861 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR1P51861 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR1P51861 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR1P51861 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR1P51861 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR1P51861 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR1P51861 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDR1P51861 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDR1P51861 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms