Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF10P50591 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF10P50591 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF10P50591 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF10P50591 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF10P50591 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF10P50591 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF10P50591 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms