Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP4P49662 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP4P49662 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP4P49662 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP4P49662 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CASP4P49662 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP4P49662 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP4P49662 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP4P49662 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP4P49662 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP4P49662 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP4P49662 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP4P49662 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP4P49662 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP4P49662 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP4P49662 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP4P49662 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP4P49662 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP4P49662 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP4P49662 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP4P49662 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP4P49662 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP4P49662 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP4P49662 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP4P49662 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP4P49662 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP4P49662 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP4P49662 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP4P49662 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP4P49662 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP4P49662 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP4P49662 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP4P49662 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CASP4P49662 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP4P49662 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP4P49662 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP4P49662 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP4P49662 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP4P49662 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP4P49662 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP4P49662 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP4P49662 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP4P49662 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP4P49662 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP4P49662 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP4P49662 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP4P49662 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP4P49662 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP4P49662 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP4P49662 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP4P49662 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASP4P49662 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP4P49662 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP4P49662 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP4P49662 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP4P49662 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP4P49662 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP4P49662 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP4P49662 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP4P49662 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP4P49662 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP4P49662 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP4P49662 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP4P49662 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP4P49662 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP4P49662 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP4P49662 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP4P49662 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms