Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CX3CR1P49238 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CX3CR1P49238 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CX3CR1P49238 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms