Protein–RNA interactions for Protein: P48634

PRRC2A, Protein PRRC2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2AP48634 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC2AP48634 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC2AP48634 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC2AP48634 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC2AP48634 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRC2AP48634 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC2AP48634 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC2AP48634 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC2AP48634 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC2AP48634 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC2AP48634 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC2AP48634 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC2AP48634 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC2AP48634 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC2AP48634 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC2AP48634 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC2AP48634 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC2AP48634 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC2AP48634 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC2AP48634 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC2AP48634 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRC2AP48634 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRC2AP48634 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC2AP48634 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms