Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PIP4K2AP48426 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PIP4K2AP48426 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PIP4K2AP48426 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIP4K2AP48426 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PIP4K2AP48426 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIP4K2AP48426 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms