Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ1P48048 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNJ1P48048 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNJ1P48048 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNJ1P48048 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNJ1P48048 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNJ1P48048 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNJ1P48048 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNJ1P48048 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms