Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABIFP47224 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABIFP47224 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RABIFP47224 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABIFP47224 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABIFP47224 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABIFP47224 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABIFP47224 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABIFP47224 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABIFP47224 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABIFP47224 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABIFP47224 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABIFP47224 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RABIFP47224 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABIFP47224 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RABIFP47224 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABIFP47224 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABIFP47224 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABIFP47224 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABIFP47224 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABIFP47224 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABIFP47224 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABIFP47224 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABIFP47224 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABIFP47224 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABIFP47224 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABIFP47224 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABIFP47224 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABIFP47224 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABIFP47224 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABIFP47224 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RABIFP47224 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABIFP47224 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RABIFP47224 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABIFP47224 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABIFP47224 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABIFP47224 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABIFP47224 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABIFP47224 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABIFP47224 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABIFP47224 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABIFP47224 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABIFP47224 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABIFP47224 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABIFP47224 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABIFP47224 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABIFP47224 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABIFP47224 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RABIFP47224 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABIFP47224 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABIFP47224 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABIFP47224 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABIFP47224 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABIFP47224 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABIFP47224 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABIFP47224 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABIFP47224 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABIFP47224 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABIFP47224 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RABIFP47224 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RABIFP47224 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABIFP47224 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABIFP47224 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABIFP47224 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABIFP47224 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABIFP47224 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABIFP47224 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABIFP47224 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABIFP47224 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABIFP47224 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABIFP47224 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABIFP47224 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABIFP47224 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABIFP47224 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABIFP47224 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABIFP47224 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABIFP47224 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABIFP47224 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABIFP47224 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABIFP47224 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABIFP47224 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABIFP47224 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABIFP47224 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABIFP47224 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms